Наред с подпомагане на научни изследвания за замяна болна тъкан със здрава, експертите също са разработили начини с които стволовите клетки могат да се изпозлват за лечение на множествена склероза. Това изследване не е общодостъпно  като лечение във Великобритания, защото все още все още се тества, но въпреки това се предлага в други страни на шепа пациенти. В миналото този вид терапии са били предлагани в Холандия, въпреки че клиниките са били съветвани да не продължават такива терапии заради въпросите относно етичността на такива терапии, които са били повдигани и все още се повдигат често. Проблема около етичността за придобиването на стволови клетки за лечение засяга само тези трансплантации, в които не са използвани лични стволови банки на пациента. При тези случаи ембрионални стволови клетки са били извличани от неуспешно оплодени ембриони при ин витро процедури. Но това поставя редица въпроси за степента на етичност при един вид убиване на ембрион с комерсиална цел.
Но какво точно представлява множествената склероза и как може да бъде повлияна от лечение чрез стволови клетки? Множествената склероза или МС за по-кратко, е растройство на нервната система, която може да причини загуба на развновесие в човек и да приини загуба на усещане в крайниците. Бърза и лесна умора, зрителни нарушения и проблеми с координацията са всички общи симптоми на МС макар и степента на сериозност на заболяването да е различна. Множествената склероза възниква, когато защитната обвивка около нервите (миелиновата обвивка) бива повредена, изстъняла или наранена. Истинската причина за заболяването все още не е изяснена напълно, но генетиката и външните фактори се смята, че играят значителна роля. Но по-важното, върху което учените са съсредоточили своите изследвания е как да излекуват МС с помощта на стволови клетки. Също както стволовите клетки от зрели и от ембрионални клетки могат да се превръщат във всеки вид клетка в тялото на човек, те следователно могат да бъдат развити и в нервни клетки и в тези, които образуват миелина. Процесът може да се осъществи чрез инжектиране на засегнатото лице със стволови клетки извлечени от собсвтвения костен мозък на лицето с цел оздравяване на засегнатите области, подмяна и попълване на изчерпаните и повредени клетки. Учените са открили изключително важна информация по време на процеса на изследването и се надяват да достигнат по-добро разбиране на процеса на заболяване участващ в сформирането на МС заедно с откриване на етични начини за извличане на стволови клетки.
Тъй като това изследване е все още в зародиш в Обединеното кралство и експертите са изключително внимателни с развитието на изследването, това лечение не се предлага особено често на страдащите от множествена склероза докато резултатите и ефектите от лечението не са били установени от опитна група. Въпреки това, може да има доброволци страдащи от това заболяване, които биха се подложили на опитно лечение под наблюдението на някоя от всички институции, предлагащи и развиващи този вид лечение. Терапията е много по-достъпна на тези, които вече имат съхранени собствени стволови клетки на изгодни цени, защото те не трябвада търсят донор, а и няма да засегнат организациите, които се борят против извличането на стволови клетки от ембриони вече отхвърлени от ин витро процедури. За сега учените трябва да продължат усъвършенстването на лечението и да открият, ако има някакво дългосрочно влияние като нежелан растеж на клетките, дългосрочни проблеми и взаимодействия както и да преосмислят рентабилността на лечението. Изследванията с лечение чрез двата вида стволови клетки – зрели и ембрионални – на МС продъ;жава всеки ден с нови и нови постижения от самото начало. Но докато всички проучвания и тествания не бъдат приключени лечението не може да се прилага и предлага като друго освен експерименталнло.