Необходимо е да се добиват хемопоетичните стволови клетки (ХСК) преди клетъчната трансплантация на автоложни стволови клетки (АСК), когато те са събрани от реципиента преди назначаването на терапия. Повечето алографти са дадени веднага след събиране с изключение на следните случаи:
• Когато са добити от кръвта от пъпната връв, от брат или сестра или други несвързани донори на стволови клетки, те се събират и складират преди процедурата и се съхраняват замразени до момента, в който са нужни.
• Когато не е възможно да култивират алогенни стволови клетки в деня на трансплантацията, например, ако донорите се намират далеч, прекалено са тревожни или имат ангажименти, които ги правят недостъпни за деня.
В тези случаи стволовите клетки могат да бъдат добити предварително и клетките се съхраняват преди трансплантацията.  Що се отнася до броя на променливите, които могат да имат влияние върху качеството на материала за трансплантация, те включват:
• Замърсяване със зрели кръвни клетки; манипулации, извършени преди съхранение, като например извличане на червените кръвни телца, разделяне на клетъчната обвивка или образуването на едноядрени клетъчни фракции.
• Клетъчната концентрация, температурата и продължителността на съхранение на стволовите клетки в течно състояние преди инфузия или криоконсервация.
• Криоконсервация – тип криозащита, скоростта на охлаждане и постоянната температура на съхранение.
Скоростта на присаждане на складирания трансплантационен материал варира в зависимост от степента на предварителна обработка, получена от пациенти, които даряват клетки за автоложна реинфузия.  Източникът на стволови клетки, също е важен, тъй като е известно, например, че кръвните стволови клетки се присаждат в организма по-бавно от тези, получени от костния мозък или периферната кръв. Броят и качеството на стволови клетки събирани и съхранявани преди приложение са от критично значение.
Доказано е при опити с мишки, чиито костен мозък е криоконсервиран с глицерол, че те са били в състояние да възстановят функцията на костния мозък след облъчването по-бавно.  Налични са обширни данни относно клиничната трансплантация, потвърждаващи, че, съхранявани при подходящи условия, хемопоетичните стволови клетки могат да възстановяват хемопоезата.
Течно съхранение на стволовите клетки
Повечето стволови клетки биват вливани или обработени малко след добиването им, но някои, като например тези от регистрирани донори, могат да се окажат в по-дълъг период на преход. До 24-48 часа [4,5]. Понякога се налага автовложните хемопоетични стволови клетки да бъдат транспортирани на далечни разстояния за обработка.
Понякога може да се окаже полезно съхранението на клетките в течен разтвор за не повче от 96 часа, тъй като криоконсервацията и размразяването водят до загуба на миелоидна колония, образуваща прогенераторните единици гранулоцит макрофаг (CFU-GM). Хемопоетичните стволови клетки, съхранявани при 4 ° С показват прогресивна загуба на ядрени клетки, клетъчна жизнеспособност и прогенератори. Данните от други лаборатории показват, че съхранението на клетките при 2-6 ° С не е в ущърб на възстановяването на стволовите клетки в организма. Продукти, съхранявани за през нощта на стайна температура, имат по ниско pH в сравнение с тези, съхранявани на 4°C. Вероятно комбинацията от клетъчната концентрация, температурата и времето на съхранение влияе върху качеството на хемопоетичните стволови клетки.
Криоконсервация хемопоетичните стволови клетки
Качеството на криоконсервираните хемопоетични стволови клетки зависи от:
• Концентрацията на клетъчната маса
• Температурата
• Интервалът между добиване и криоконсервация
• Наличието на зрели кръвни клетки
• Манипулации преди съхранение и криоконсервация
Обикновено тези фактори взаимодействат помежду си. Например, установено е, че ако клетките се съхраняват една нощ при стайна температура с клетъчна концентрация по-голяма от 200 х 109 / L, има значително намаляване на жизнеспособността им и на възстановяване прогенераторните им показатели. Клетките се съхраняват при 400-500 х 109 / L, но криоконсервираните в рамките на 4 часа показват задоволително възстановяване. Какви са причините това съотношение да е от такова значение?
• Гранулоцити и тромбоцити може да се слепнат и да попречат на преработката на стволовите клетки.
• Червените кръвни телца могат да лизират след размразяването и инфузията, което води до бъбречна недостатъчност.
• Голям брой клетки могат да изискват замразяване в големи количества, което води до обемно претоварване и криопротекторна с токсичност при инфузията.
Степен на замразяване
Основният принцип в успешната клетъчна криопрезервацията е предотвратяването на образуването на ледени кристали по време на охлаждане. Това е основната причина за увреждане на клетките. Ако клетките се охлаждат прекалено бързо, се образуват вътреклетъчни ледени кристали. В резултат се стига до механично разрушаване на клетките и тяхното унищожаване. При бавни темпове на охлаждане, ледените кристали се образуват в извънклетъчното пространство, което води до повишена осмоларност, като освободената вода се разтваря. Това причинява клетъчна дехидратация.  Глицеролът може да предотврати обезводняването чрез инхибиране на повишена концентрация на натрий. Обезводняването може да възникне при образуването на лед и чрез намаляване на количеството абсорбирана вода в ледените кристали. Оптималната степен на охлаждане се влияе от вида на криопротектора и клетките се замразяват. Когато настъпи преминаването от течно към твърдо състояние, латентната топлина на стапяне бива освободена и това причинява появата на така наречената крива на замръзване.